Перлит - идеальный материал для укоренения черенков растений, которые не желают окореняться в простой воде. В почве для многих трудноукореняемых комнатных цветов (кальцеолярии, клубневые бегонии, гортензии, азалии, розы) среда часто несет биологическую опасность срезанному черенку: это риск инфицирования клеток растения грибами и бактериями, а также не всегда благоприятна механическая структура почвы для черенков. Корешки образуются из молодых клеток растения, подгоняемых соком к срезанной раненой поверхности: в соке имеются и фитогормоны, и крахмал, из которых инициируется рост различных групп тканей корневой системы в процессе митотического (клеточного) деления. Внешний слой клеток корневого волоска имеет скользкую поверхность для того, чтобы прилипать к почве и добывать из нее микрочастицы воды и питания. Но для образования корней некоторым растениям часто необходима аэрация - воздухообмен, так как через корневую систему растение не только впитывает, но и выделяет различные продукты. Перлит благодаря своей пористой структуре сохраняет «свободные места», заполненные воздухом и влагой, создавая «проветривание». Поэтому перлит предотвращает загнивание черенков таких растений, в отличие от укоренения их в чистой воде или в почве.

Перлит применяют часто в смеси 1:1 с песком или вермикулитом, а также с рубленым мхом сфагнумом, почвой, торфом, он снижает риск заболевания рассады «черной ножкой», но сам по себе не является питательной средой. Поэтому выращивание растений чисто на перлите требует регулярного внесения гидропонных питательных растворов и специальных органических удобрений (бактериальных удобрений) с живыми организмами для создания полезной микрофлоры.

• В перлите легко намачивать и проращивать семена, мульчировать сеянцы для удержания влаги в мелких плошках и горшках, чтобы почва не высыхала мигом, когда семена высевают специально на рассаду в неглубокие кассеты.
• Перлитом можно присыпать светочувствительные семена, проращивание которых проходит обычно на свету без присыпания почвой. Он пропускает некоторое количество солнечных лучей, поэтому также применяется в качестве субстратов для тех культур, у которых корни живут на поверхности почвы, так как содержат молекулы хлорофилла, и в корнях происходит фотосинтез, подкармливающий такие растения. Это, как правило, эпифиты бромелиевые и орхидные. Перлит защитит их корешки от плесени и пересыхания.
• Но необходимо помнить, что наряду с кондиционированием корневой системы перлит придает эффект термоизоляции, а это для одних растений может быть полезно, а для других вредно. Перлит сглаживает суточное колебание температуры, поэтому растениям, которым для цветения необходим перепад ночной и дневной температуры (а это кактусы, литопсы, некоторые суккуленты, некоторые орхидные), чистый перлитовый субстрат может оказаться и не очень полезен. Тогда его лучше использовать только в смеси с почвой в доле не более 40%. Но также в жаркие периоды перлит сохраняет корневую систему от перегрева, а в холодное время суток - от переохлаждения.
• Используют перлит и в качестве дренажа в мелкогабаритных цветочных вазонах, и в качестве мульчи. Белая окраска минерала имеет высокую отражательную способность и защищает почву от перегрева.
• На увлажненный перлит, уложенный на плоские блюда или подносы, можно ставить цветы, не терпящие сухость воздуха, влага из него будет испаряться медленно и равномерно.
• Перлит идеален в силу своей пористой структуры для растений на фитильном поливе, а также для комнатных крупномеров: его низкий удельный вес позволяет наполнять огромные горшки и в последствии легко транспортировать их с места на место.

Недостатки применения перлита:

При работе с перлитом цветовод может пострадать от попадания пыли в глаза. Перлит сильно пылит, и проникает в дыхательные пути. Поэтому его необходимо смачивать из пульверизатора водой. Промывать перлит можно только сквозь мелкодисперсное сито, но не погружая в воду, так как плотность его меньше воды и он плавает на поверхности, не тонет. Если перлит промывать погружением в воду, то вынимать его приходится вычерпыванием ситом. Перлит плохо держит буферность среды, поэтому часто при поливе жесткой водой или применении калийной или кальциевой селитры чистый перлитовый субстрат защелачивается - происходит сдвиг рН в щелочную среду, поэтому чистый перлит не годится для выращивания растений, предпочитающих слабо кислый грунт (узамбарских фиалок), либо применять комплексные минеральные удобрения, у которых среда как раз слабо-кислая.